1995年成立信息网络中心挂靠计算机科学与工程系，负责校园网运行与维护的管理和服务。2018年，为进一步加强学校信息化工作，成立信息化办公室，作为学校职能部门，统筹全校信息化工作的顶层规划和管理建设。

2023年学校机构改革，更名为网络信息中心，不再保留信息化办公室。在学校网络安全和信息化办公室的统筹规划指导和协调下，网络信息中心负责统筹智慧北航建设等的具体实施，承担学校信息化基础设施的建设和运行服务工作，为学校信息化建设和服务提供保障；负责统筹学校各单位数据，规范并协调各单位数据交换共享；负责学校信息化基础设施、校级公共平台信息系统的建设和运行维护工作；负责防范、应对网络攻击和安全风险，组织开展网络安全等级保护测评，落实学校网络舆情信息管控和网络安全防护的技术保障；负责学校网络安全和信息化宣传、培训工作；高性能计算中心负责校级高性能计算平台的统筹规划和运维管理。